[Wanilton]

@LucianoBadoe, isto não tem haver com o fato de ter feito upgrade, provável que tenha segundo vídeo como amostra ou trailers nas pastas, e sem restrição via advancedsettings.xml vai duplicar mesmo, eis o que uso aqui para evitar.

Code:

<advancedsettings>
    <video>
        <!-- VideoExtras: Section Start -->
        <excludefromscan action="append">
            <regexp>-extras-</regexp>
            <regexp>/Extras/</regexp>
            <regexp>[\\/]Extras[\\/]</regexp>
            <regexp>-trailer-</regexp>
            <regexp>/trailer/</regexp>
            <regexp>[\\/]trailer[\\/]</regexp>
        </excludefromscan>
        <excludetvshowsfromscan action="append">
            <regexp>-extras-</regexp>
            <regexp>/Extras/</regexp>
            <regexp>[\\/]Extras[\\/]</regexp>
            <regexp>-trailer-</regexp>
            <regexp>/trailer/</regexp>
            <regexp>[\\/]trailer[\\/]</regexp>
        </excludetvshowsfromscan>
        <!-- VideoExtras: Section End -->
    </video>   
</advancedsettings>

Podes verificar na info de vídeo o caminho para o arquivo de vídeo que está duplicando o item na coleção.

Uma opção limpar estes vídeos extras, e depois mandar limpar coleção no Kodi. 

Ou usar o advancedsettings, remover o database de vídeo atual, e rescrapear a coleção.